Introduction
Le microbiote intestinal est un écosystème complexe et fascinant de micro-organismes qui vivent à l’intérieur de notre corps. La plupart des microbes du tractus gastro-intestinal résident dans le gros intestin, le reste se trouvant principalement dans l’intestin grêle et l’estomac ainsi que dans notre bouche. Le microbiote intestinal est constitué de bactéries, de virus, de champignons, de protistes, d’archées et d’autres micro-organismes essentiels à notre santé et à notre bien-être. On estime que le nombre de gènes microbiens présents dans l’intestin dépasse largement le nombre de gènes humains. Une estimation toute aussi approximative de 1 000 espèces bactériennes dans l’intestin avec 2 000 gènes par espèce donne une estimation de 2 000 000 de gènes, soit 100 fois le nombre de gènes humains. Ces chiffres soulignent le fait que nous ne sommes pas seuls dans notre corps. La composition et le fonctionnement du microbiote intestinal ont été associés à de nombreux aspects de la santé humaine, notamment la digestion, le métabolisme, le fonctionnement du système immunitaire, le cancer, l’efficacité des médicaments, l’obésité, la longévité, les performances sportives, la maladie de Parkinson et même la santé mentale. Comprendre la diversité génétique de ces microbes est crucial car cela peut donner un aperçu de leurs rôles potentiels dans la santé et la maladie. Explorons plus en détail pourquoi le microbiome est si important pour la santé humaine, à travers le lot d’études faites in vitro, chez le modèle animal et auprès de diverses populations.
Qu’est-ce que le microbiome intestinal ?
Tel que mentionné en introduction, le microbiome intestinal est une écologie très active de micro-organismes qui résident dans notre tube digestif. Il est composé d’un large éventail de bactéries, virus, champignons et autres organismes microscopiques qui jouent un rôle essentiel dans notre santé globale.
Bien que le microbiote intestinal soit unique à chaque individu, certains points communs peuvent être trouvés chez les personnes en bonne santé.
On estime que le corps humain contient environ 37 000 milliards de cellules humaines, tandis que le microbiote intestinal est constitué de 100 000 milliards de cellules microbiennes. Ce nombre est deux fois et demie, supérieur au nombre de cellules humaines dans l’ensemble du corps. Cela signifie que notre organisme est, en termes de nombre de cellules, plus microbien qu’humain.
Tous ces milliards de microbes habitent l’ensemble du tractus gastro-intestinal (GI), passant de la bouche au côlon, formant un écosystème dynamique et complexe jouant un rôle crucial dans la digestion.
Le contact avec les microbes de notre tractus gastro-intestinal (GI) commence dès notre première bouchée. Lorsque nous mâchons nos aliments et les mélangeons avec des micro-organismes présents dans la salive de notre bouche, nous introduisons des bactéries dans notre système. Ces dernières descendent ensuite dans l’œsophage et dans l’estomac, où elles rencontrent un environnement hostile d’acide gastrique. Cependant, certaines d’entre elles sont capables de survivre à cet environnement acide et poursuivent leur voyage.
Une fois dans l’intestin grêle, environnement plus favorable, on retrouve une quantité intéressante de bactéries, puisque cet organe fournit des nutriments et une muqueuse qui leur permettent de se développer. À mesure que la nourriture passe dans l’intestin grêle, les bactéries continuent de décomposer les glucides complexes et d’autres substances.
Lorsqu’on atteint le gros intestin, le nombre et la diversité des micro-organismes augmentent. C’est là que réside la majorité de notre microbiote intestinal. Le gros intestin offre un environnement propice à la prolifération des bactéries, grâce à sa température chaude et à la disponibilité de nutriments.
Dans tout le tractus gastro-intestinal, les microbes adhèrent à la muqueuse intestinale et forment des biofilms, qui sont des communautés de micro-organismes. Ces biofilms empêchent les bactéries d’être emportées par les aliments qui passent et leur fournissent un environnement stable pour vivre.
Dans le côlon , dernière section du tractus gastro-intestinal, les bactéries jouent un rôle déterminant dans la fermentation des glucides non digérés et dans la production d’acides gras à chaîne courte. Ces acides gras à chaîne courte sont importants pour maintenir la santé des cellules du côlon et jouent un rôle clé dans l’inflammation.
Pourquoi le microbiote intestinal est-il important ?
Un microbiote intestinal sain se caractérise par une population diversifiée de micro-organismes associés à la santé. Comme mentionné précédemment, ces derniers travaillent ensemble pour digérer les glucides complexes et les fibres que notre corps ne peut pas décomposer seul. Lorsque vous consommez des aliments comme des grains entiers, des légumes et des légumineuses, votre microbiote intestinal joue un rôle crucial dans la fermentation de ces composants non digestibles en acides gras à chaîne courte (AGCC) comme le butyrate, l’acétate et le propionate. Les AGCC servent de source d’énergie pour les cellules tapissant le côlon, aidant à maintenir la santé de la muqueuse intestinale, possédant des propriétés anti-inflammatoires et jouant également un rôle dans la régulation du métabolisme et de l’appétit.
Votre microbiote prend également une place centrale dans la régulation de l’immunité. En fait, environ 70 % de nos cellules immunitaires se trouve dans notre intestin. Votre intestin agit comme un terrain d’entraînement pour les cellules immunitaires, leur apprenant à faire la distinction entre les agents pathogènes nocifs et les microbes bénéfiques.
Certains microbes intestinaux produisent également des nutriments essentiels comme des vitamines (par exemple, les vitamines B et la vitamine K) et des acides aminés qui sont nécessaires à divers processus physiologiques de l’organisme tels que; l’équilibre du métabolisme, la fonction nerveuse, la coagulation sanguine et la santé des os.
Comment maintenir la stabilité du microbiote ?
Le maintien d’une composition optimale du microbiome est prépondérant pour notre santé et notre bien-être général. Malgré l’afflux constant de nouvelles bactéries et autres micro-organismes, notre microbiote intestinal dispose de mécanismes lui permettant de maintenir une composition relativement équilibrée chez les adultes en bonne santé. Cette stabilité est maintenue en premier lieu grâce à une combinaison de compétition entre micro-organismes. Dans un intestin sain, il existe un écosystème stable qui rend difficile la domination des organismes nuisibles. De plus, l’environnement intestinal lui-même joue un rôle dans le maintien de l’équilibre via la température, les niveaux de pH, les niveaux d’oxygène, etc. L’intestin offre un environnement idéal pour la croissance de certains microbes tout en étant moins propice à l’augmentation de d’autres. Le niveau de variabilité des constituantes du microbiote peut également être maintenu grâce à une alimentation équilibrée riche en fibres, des choix alimentaires diversifiés et des aliments probiotiques et prébiotiques.
Comprendre et maintenir la stabilité du microbiote est essentiel pour la santé et le bien-être en général, et ces connaissances constituent le fondement des nouvelles approches de santé personnalisées telles que; les régimes alimentaires basés sur le microbiote.
Microbiote et nutrition personnalisée
Comprendre la composition spécifique du microbiote d’un individu peut potentiellement permettre des approches individualisées en matière de santé et de nutrition. Les régimes personnalisés basés sur le microbiote intestinal, souvent appelés « régimes basés sur le microbiote » ou « nutrition de précision », constituent un domaine émergent de recherche et d’optimisation de la santé. Ces régimes sont basés sur une analyse du microbiote effectuée grâce à des techniques telles que le séquençage métagénomique, qui fournit des informations sur les types et l’abondance relative des micro-organismes dans le tube digestif. Les données du microbiome sont ensuite utilisées pour établir le profil du microbiote intestinal de l’individu, notamment la présence d’espèces bactériennes spécifiques, la diversité et la capacité fonctionnelle. Ce profil peut être lié à la littérature pour comprendre comment le microbiote affecte la santé et comment les changements alimentaires peuvent orienter le microbiote dans une direction cible. L’objectif de ces procédures est d’identifier les modèles microbiens spécifiques associés à des problèmes de santé et de formuler des recommandations diététiques pour améliorer le microbiote associé à ces problèmes. Les personnes qui suivent un régime distinctif basé sur le microbiote peuvent subir une surveillance régulière de leur microbiote intestinal pour évaluer l’impact des changements alimentaires sur leur composition microbienne et leur santé globale, et ajuster leur alimentation en conséquence.
L’idée derrière ces façons personnalisées de s’alimenter est d’adapter les recommandations alimentaires à la composition et à l’activité uniques du microbiome intestinal d’un individu afin d’améliorer certains aspects de sa santé. En analysant le microbiome d’une personne, les prestataires de soins de santé souhaitent proposer des recommandations ciblées sur l’alimentation, les probiotiques et les traitements médicaux afin d’optimiser les résultats de santé. Cette façon de faire pourrait révolutionner notre approche des soins de santé en reconnaissant que le modèle « taille unique » de changements alimentaires ne s’applique pas à tout le monde.
Associations du microbiote aux problèmes de santé
Lorsque notre microbiote intestinal est perturbé, cela peut conduire à une dysbiose intestinale. La recherche a établi un lien entre la dysbiose intestinale et des affections telles que; l’obésité et le diabète de type 2, car des changements dans la composition des bactéries intestinales peuvent affecter le métabolisme des nutriments alimentaires, entraînant une augmentation de l’inflammation et de la résistance à l’insuline. De plus, un microbiote dysbiotique (perturbé) peut influencer le stockage des graisses et l’extraction d’énergie des aliments.
De surcroît, le microbiote intestinal influence notre santé mentale. Des recherches récentes ont montré un lien étroit entre l’intestin et le cerveau, connu sous le nom d’axe intestin-cerveau . Un microbiote sain aide à produire des neurotransmetteurs, tels que; la sérotonine, souvent appelée l’hormone du « bien-être ». Les déséquilibres du microbiote intestinal ont été associés à des troubles de santé mentale comme l’anxiété et la dépression, où la recherche indique un rôle potentiel de certains genres de bactéries, tels que Bifidobacterium et Lactobacillus, dans la promotion du bien-être mental. De plus, l’association entre les instabilités du microbiote intestinal et le développement de maladies neurodégénératives comme la maladie de Parkinson ou la maladie d’Alzheimer a été trouvée. Une diminution des Prévotellaceae et une augmentation des Enterobacteriaceae ont été observées chez les individus atteints de ces maladies. On pense que ces changements pourraient potentiellement contribuer aux processus neuro inflammatoires associés à ces maladies.
Il convient également de souligner que le microbiote intestinal joue un rôle dans la modulation du système immunitaire, ce qui peut avoir un impact sur la capacité de l’organisme à reconnaître et à contrôler les cellules cancéreuses . La dysbiose peut contribuer à l’inflammation chronique, qui est un facteur de risque connu de développement du cancer. De plus, les chercheurs ont découvert que les fluctuations hormonales, en particulier dans la santé des femmes, peuvent influencer le microbiote intestinal et, inversement, le microbiote intestinal peut avoir un impact sur le métabolisme hormonal. La dysbiose peut jouer un rôle dans des affections telles que le syndrome des ovaires polykystiques (SOPK) et les déséquilibres hormonaux. La santé intestinale peut également affecter le métabolisme des œstrogènes, influençant potentiellement les affections liées aux œstrogènes, telles que l’endométriose.
De plus, l’axe intestin-peau est un sujet qui intéresse particulièrement les scientifiques. Ce concept suggère un lien entre la santé intestinale et les affections cutanées . La dysbiose du microbiote intestinal peut contribuer à des problèmes de peau comme l’acné, l’eczéma et le psoriasis. L’inflammation déclenchée par des déséquilibres du microbiote intestinal peut se manifester par une inflammation cutanée. Il existe plusieurs bactéries essentielles au maintien d’une peau saine, parmi lesquelles Firmicutes et Bacteroidetes. Un déséquilibre entre Firmicutes et Bacteroidetes a été associé à des conditions liées à une inflammation systémique, qui pourraient potentiellement affecter la peau. De plus, Akkermansia muciniphila a été associée à la couche muqueuse intestinale et à la santé intestinale. Des changements dans son abondance ont été observés dans divers problèmes de santé tels que le psoriasis, et cela pourrait avoir des implications plus larges sur l’inflammation systémique et la santé de la peau. De plus, certaines souches de Bifidobacterium sont considérées comme des bactéries probiotiques bénéfiques et ont été associées à des effets anti-inflammatoires. La modulation de l’équilibre des Bifidobacterium dans l’intestin peut avoir des implications sur la régulation du système immunitaire, ce qui pourrait avoir une répercussion positive sur les affections cutanées.
Comprendre le microbiome intestinal est crucial pour maintenir notre santé et notre bien-être en général. En favorisant un microbiote sain grâce à une alimentation et des choix de mode de vie appropriés, nous pouvons soutenir notre système immunitaire, améliorer la digestion et améliorer notre santé globale. Le profilage de votre microbiome individuel est un outil puissant et émergent pour mieux comprendre votre santé intestinale et ses liens potentiels avec diverses affections et symptômes. Il permettra d’ici quelques années, d’être utilisés par les cliniciens pour offrir des soins de santé personnalisés, aider à identifier la dysbiose, découvrir les déclencheurs, guider les interventions ciblées, permettre de suivre les progrès et contribuer aux efforts de recherche en cours. Pour en savoir plus sur le microbiote intestinal et la santé digestive, nous vous recommandons de vous abonner à notre infolettre bi-mensuelle.
Conclusion
Le microbiome intestinal est un écosystème remarquable qui a un impact profond sur notre santé. En donnant la priorité à sa santé, nous pouvons optimiser notre digestion, donner un coup de pouce à nos défenses immunitaires, maintenir un poids équilibre et favoriser notre bien-être mental. Prendre soin de notre microbiote intestinal est véritablement un investissement dans notre santé globale et notre qualité de vie.
Comprendre l’importance du microbiote intestinal est aidant pour faire de meilleurs choix de vie et d’alimentation pour soutenir sa santé. Un moyen essentiel consiste à adopter une alimentation saine et variée. Manger une large gamme de fruits, de légumes, de grains entiers et d’aliments fermentés riches en fibres peut aider à nourrir différentes espèces de micro-organismes. De plus, éviter l’utilisation excessive d’antibiotiques lorsque c’est possible, gérer le stress et dormir suffisamment peuvent également favoriser la diversité du microbiome.
Les scientifiques étudient continuellement l’importance du microbiome intestinal pour notre santé globale. Pour découvrir ce qui est le mieux pour votre santé, il vous est possible d’examiner votre propre microbiome intestinal, de comprendre son lien avec divers problèmes de santé et de déterminer quels changements de régime alimentaire et de mode de vie pourraient vous convenir le mieux. Vous pouvez lire plus d’information sur le sujet, en consultant la page de l’analyse de microbiote Jona.
Andréanne Martin
Fondatrice de la Clinique Épithélia & EpitheliaPro
Équipe de diététistes-nutritionnistes